DNA 的蛋白質編碼能力

本工具可計算蛋白質長度、蛋白質分子量或 DNA 長度。

DNA 的蛋白質編碼能力是指其序列中僅佔極小一部分(在人類中不到 2%)的區域,這些區域包含基因,提供合成蛋白質的指令。DNA 透過三聯密碼子(codon)來指定胺基酸,而絕大多數 DNA 屬於非編碼區域,但在調控層面發揮關鍵作用。 蛋白質編碼能力決定了理論上可生成的蛋白質數量,但如可變剪接等生物學機制,使實際產生的蛋白質種類遠多於基因數量。本工具僅提供對 DNA 編碼能力的非常基礎估算。

蛋白質編碼能力的關鍵面向

  • 比例極小:
    蛋白質編碼基因僅佔整個基因組的一小部分,估計約為 DNA 總量的 1–2%。
  • 三聯密碼:
    DNA 使用由三個鹼基組成的序列(密碼子)來編碼特定的胺基酸,而胺基酸是蛋白質的基本組成單元。
  • 基因與蛋白質:
    人類約有 19,000–20,000 個蛋白質編碼基因,但由於可變剪接等機制,一個基因可產生多種不同的蛋白質。
  • 非編碼 DNA:
    其餘約 98% 的 DNA,曾被稱為「垃圾 DNA」,實際上在基因調控中至關重要,包括基因的啟動與關閉(如啟動子與增強子)。
  • 計算方式:
    一個簡單公式描述 DNA 長度與蛋白質長度之間的關係:編碼的胺基酸數 = DNA 鹼基數 / 3。相關工具可用於根據 DNA 長度估算蛋白質大小。

計算公式

其關係由以下公式描述:

編碼的胺基酸數 = DNA 長度(鹼基數) / 3
DNA 長度 = 3 × 胺基酸數量
預測蛋白質大小 = 胺基酸數量 × 0.11 kDa

0.11 kDa 為單一胺基酸的平均分子量

運作原理

  • 轉錄:
    蛋白質編碼 DNA 序列(基因)被複製為信使 RNA(mRNA)。
  • 翻譯:
    核糖體以密碼子(三個鹼基為一組)的方式讀取 mRNA,並依序組裝對應的胺基酸。
  • 蛋白質合成:
    由胺基酸組成的多肽鏈摺疊形成具有功能的蛋白質。

重要性

  • 功能性 DNA:
    儘管比例極小,編碼 DNA 對生物功能至關重要,相關哺乳動物在功能性 DNA 的比例上高度相似。
  • 基因組複雜性:
    非編碼區域,尤其是調控元件,決定蛋白質在何時、何地被表現,使基因組的複雜性遠超單純的編碼序列。
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